Публикации автора

Серая славка Curruca communis (Latham, 1787) - многочисленная воробьинообразная птица Пале арк тики семейства Sylviidae. Исследования митохондриальных геномов в этой группе, претерпевшей из менения в систематике, ограничены, особенно в недавно восстановленном роде Curruca. Нами описан и охарактеризован полный митогеном C. communis, и определено филогенетическое положение вида. Митогеном был секвенирован с помощью митохондриального обогащения и собран de novo. Длина ми тогенома составляет 17141 п. о., с составом оснований 32.1% C, 30.4% A, 23.6% T и 13.9% G. В его состав входят 13 белоккодирующих генов, два гена рибосомной РНК, 22 гена транспортной РНК и два кон трольных региона неодинаковой длины. Анализ использования кодонов в белоккодирующих генах показал, что среди аминокислот наиболее высокая частота использования характерна для лейцина, далее следуют треонин и аргинин, а наименьшее значение отмечено для цистеина. Филогенетическое дерево, построенное методом максимального правдоподобия, показало с высочайшим уровнем под держки, что C. communis занимает сестринское положение по отношению к кладе, включающей два других вида рода Curruca. Анализ селективного давления демонстрирует сильный очищающий отбор для всех трех видов этого рода с известными митогеномами. Паттерны участков контрольного регио на идентичны для митогеномов Curruca, но не для большинства известных митогеномов второго рода семейства, Sylvia. У видов Curruca имеется один длинный и второй укороченный контрольный регион, что нетипично для надсемейства Sylvioidea в целом, где чаще встречаются два почти равных по дли не контрольных региона. В данном исследовании впервые представлен опубликованный митогеном C. communis, который может быть использован для изучения эволюции и популяционной генетики это го вида, а также для дальнейших исследований филогении и таксономии славковых.