1. Микробиом сельскохозяйственных животных: связь со здоровьем и продуктивностью / Г.Ю. Лаптев, Н.И. Новикова, Е.А. Йылдырым [и др.]. - СПб.: Проспект Науки, 2020. - 336 с.
2. Ghosh, A. Methods of assessment of microbial diversity in natural environments / A. Ghosh, P. Bhadury // Microbial Diversity in the Genomic Era; S. Das, H.R. Dash (Eds.). - The Netherlands: Elsevier, 2019. - P. 3-14. DOI: 10.1016/B978-0-12-814849-5.00001-0
3. Hugenholtz, P. Exploring prokaryotic diversity in the genomic era / P. Hugenholtz // Genome Biol. - 2002. - V. 3. - No 2. - REVIEWS0003. DOI: 10.1186/gb-2002-3-2-reviews0003
4. Современные представления о микрофлоре кишечника птицы при различных рационах питания: молекулярно-генетические подходы / В.И. Фисинин, Г.Ю. Лаптев, И.А. Егоров [и др.]. - Сергиев Посад: ВНИТИП, 2017. - 263 с.
5. Rappé, M.S. The uncultured microbial majority / M.S. Rappé, S.J. Giovannoni // Annu. Rev. Microbiol. - 2003. - V. 57. - P. 369-394.
6. Hrovat, K. Taxonomic resolution of different 16S rRNA variable regions varies strongly across plant-associated bacteria / K. Hrovat, B.E. Dutilh, M.H. Medema, C. Melkonian // ISME Commun. - 2024. - V. 4. - No 1. - P. ycae034. DOI: 10.1093/ismeco/ycae034
7. Liu, W.T. Characterization of microbial diversity by determining terminal restriction fragment length polymorphisms of genes encoding 16S rRNA / W.T. Liu, T.L. Marsh, H. Cheng, L.J. Forney // Appl. Environ. Microbiol. - 1997. - V. 63. - No 11. - P. 4516-4522. DOI: 10.1128/aem.63.11.4516-4522.1997
8. Hewson, I. Richness and diversity of bacterioplankton species along an estuarine gradient in Moreton Bay, Australia / I. Hewson, J.A. Fuhrman // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - V. 70. - No 6. - P. 3425-3433. DOI: 10.1128/AEM.70.6.3425-3433.2004
9. Reid, G. High throughput sequencing methods and analysis for microbiome research / G. Reid // Curr. Pharm. Des. - 2005. - V. 11. - No 1. - P. 11-16. DOI: 10.2174/1381612053382395
10. Йылдырым, Е.А. Микробиом кур: современный взгляд / Е.А. Йылдырым, Л.А. Ильина, В.А. Филиппова, Е.П. Горфункель, А.В. Дубровин, Н.И. Новикова, Д.Г. Тюрина, Г.Ю. Лаптев // Птицеводство. - 2019. - №1. - С. 43-49. DOI: 10.33845/0033-3239-2019-68-1-43-49
11. Дмитриев, К.Ю. Применение молекулярно-биологических методов исследований в птицеводстве / К.Ю. Дмитриев // Птицеводство. - 2021. - №12. - С. 59-63. DOI: 10.33845/0033-3239-2021-70-12-59-63
12. Егоров, И.А. Экспрессия генов, состав микробиома кишечника и биохимические показатели крови при использовании белого люпина в комбикормах для бройлеров / И.А. Егоров, В.Г. Вертипрахов, Т.Н. Ленкова, В.А. Манукян, В.И. Смоленский, О.В. Мясникова // Птицеводство. - 2020. - №12. - С. 15-20. DOI: 10.33845/0033-3239-2020-69-12-15-20
13. Холодилина, Т.Н. Продуктивные качества, переваримость кормов и кишечный микробиом у цыплят-бройлеров (Gallus gallus L.) при добавлении в рацион нативных и экструдированных углеводных компонентов / Т.Н. Холодилина, Е.В. Яушева, К.В. Рязанцева, Е.А. Сизова, К.С. Нечитайло // С.-х. биология. - 2024. - Т. 59. - №2. - С. 274-288. DOI: 10.15389/agrobiology.2024.2.274rus
14. Кван, О.В. Влияние ультрадисперсных частиц меди и железа на микробиоценоз кишечника цыплят-бройлеров / О.В. Кван, Е.А. Сизова, И.А. Вершинина // Агр. наука. - 2024. - №2. - С. 61-65. DOI: 10.32634/0869-8155-2024-379-2-61-65
15. Кван, О.В. Минеральный обмен и микробное разнообразие слепого отдела кишечника у цыплят-бройлеров (Gallus gallus L.) при включении в полусинтетический рацион пищевых волокон / О.В. Кван, Е.А. Сизова, И.А. Вершинина, А.М. Камирова // С.-х. биология. - 2023. - Т. 58. - №4. - С. 700-712. DOI: 10.15389/agrobiology.2023.4.700rus
16. Ленкова, Т.Н. Микробиота кишечника и продуктивные качества бройлеров при использовании фитазы для повышения усвояемости фосфора и питательных веществ из комбикормов / Т.Н. Ленкова, И.А. Егоров, Т.А. Егорова [и др.] // С.-х. биология. - 2020. - Т. 55. - №2. - С. 406-416. DOI: 10.15389/agrobiology.2020.2.406rus
17. Тюрина, Д.Г. Сравнительная оценка влияния вирджиниамицина и пробиотика на состав кишечного микробиома и зоотехнические показатели цыплят-бройлеров (Gallus gallus L.) / Д.Г. Тюрина, Г.Ю. Лаптев, Е.А. Йылдырым [и др.] // С.-х. биология. - 2020. - Т. 55. - №6. - С. 1220-1232. DOI: 10.15389/agrobiology.2020.6.1220rus
18. Кочиш, И.И. От науки к практике: рациональный подход к контролю микрофлоры кишечника птицы / И.И. Кочиш, О.В. Мясникова, И.Н. Никонов, А.А. Худяков // Птицеводство. - 2023. - №1. - С. 39-42. DOI: 10.33845/0033-3239-2023-72-1-39-42
19. Кочиш, И.И. Оценка эффективности действия синбиотика на микробиом кишечника цыплят-бройлеров в условиях промышленной птицефабрики / И.И. Кочиш, О.В. Мясникова, И.Н. Никонов, М.В. Ласенко, П.Е. Шкарлат // Птицеводство. - 2023. - №6. - С. 29-34. DOI: 10.33845/0033-3239-2023-72-6-29-34
20. Wang, L. Effects of lactic acid bacteria isolated from Tibetan chickens on the growth performance and gut microbiota of broiler / L. Wang, Z. Lin, M. Ali, X. Zhu, Y. Zhang, S. Li, K. Li, F. Kebzhai, J. Li // Front. Microbiol. - 2023. - V. 14. - P. 1171074. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1171074
21. Joo, S.S. The modulatory effects of Lacticaseibacillus paracasei strain NSMJ56 on gut immunity and microbiome in early-age broiler chickens / S.S. Joo, J.H. Yoon, J.Y. Jung, S.Y. Joo, S.H. An, B.C. Ban, C. Kong, M. Kim // Animals. - 2022. - V. 12. - No 23. - P. 3413. DOI: 10.3390/ani1223341
22. Багиров, В.А. Метагеномный анализ микробиома кишечника и биохимический состав мяса бройлеров при использовании растительного экстракта Quercus cortex в рационах / В.А. Багиров, А.С. Ушаков, Г.К. Дускаев, О.В. Кван, Ш.Г. Рахматулин, Е.В. Яушева, И.А. Вершинина // С.-х. биология. - 2020. - Т. 55. - №4. - С. 682-696. DOI: 10.15389/agrobiology.2020.4.682rus
23. Дускаев, Г.К. Влияние малых молекул растительного происхождения на микробное разнообразие слепого отдела кишечника цыплят-бройлеров / Г.К. Дускаев, Л.В. Власенко, Д.Б. Косян, М.Я. Курилкина // Птицеводство. - 2023. - №4. - С. 46-51. DOI: 10.33845/0033-3239-2023-72-4-46-51
24. Urban, J. Enhancing broiler chicken health and performance: the impact of phytobiotics on growth, gut microbiota, antioxidants, and immunity / J. Urban, K.Y. Kareem, A. Matuszewski, D. Bień, P. Ciborowska, K. Lutostański, M. Michalczuk // Phytochem. Rev. - 2024. DOI: 10.1007/s11101-024-09994-0
25. Rubens, J. Application of Baltic pine (Pinus sylvestris) needle extract as a gut microbiota-modulating feed supplement for domestic chickens (Gallus gallus) / J. Rubens, J. Kibilds, M. Jansons [et al.] // Plants. - 2023. - V. 12. - No 2. - P. 297. DOI: 10.3390/plants12020297
26. Лаптев, Г.Ю. Влияние глифосата и пробиотика на микробиом цыплят-бройлеров / Г.Ю. Лаптев, Д.Г. Тюрина, Е.П. Горфункель [и др.] // Птицеводство. - 2022. - №11. - С. 35-43. DOI: 10.33845/0033-3239-2022-71-11-35-43
27. Йылдырым, Е.А. Состав и метаболический потенциал микробиома кишечника бройлеров Gallus gallus L. под влиянием кормовых добавок при экспериментальном Т-2 токсикозе / Е.А. Йылдырым, А.А. Грозина, В.Г. Вертипрахов [и др.] // С.-х. биология. - 2022. - Т. 57. - №4. - С. 743-761. DOI: 10.15389/agrobiology.2022.4.743rus
28. Shanmugasundaram, R. Subclinical doses of dietary fumonisins and deoxynivalenol cause cecal microbiota dysbiosis in broiler chickens challenged with Clostridium perfringens / R. Shanmugasundaram, J. Lourenco, W.A. Hakeem, M.M. Dycus, T.J. Applegate // Front. Microbiol. - 2023. - V. 14. - P. 1106604. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1106604
29. Wu, Z. Pesticide thiram exposure alters the gut microbial diversity of chickens / Z. Wu, R. Su // Front. Microbiol. - 2022. - V. 13. - P. 966224.