В статье исследуются проблемы противодействия распространению экстремизма среди лиц, содержащихся в исправительных колониях и следственных изоляторах уголовно-исполнительной системы Российской Федерации. Рассматриваются условия, способствующие распространению религиозного экстремизма, основными из которых являются: отсутствие методик и способов эффективного выявления, противодействия и профилактики исламской экстремистской идеологии; рост числа подозреваемых, обвиняемых и осужденных за совершение преступлений террористического характера и экстремистской направленности; существенное увеличение числа заключенных-мусульман; недостаточная просветительская работа исламского духовенства по разъяснению духовных ценностей ислама заключенным, в ряде случаев мусульманскую миссионерскую деятельность осуществляют радикальные исламисты, осужденные за терроризм; неготовность исламского духовенства к работе с заключенными, пропагандирующими и поддерживающими экстремистскую идеологию. Даются рекомендации по улучшению организации противодействия распространению религиозного экстремизма.