Статья: ПОИСК ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО ЭКСПРЕССИРУЕМЫХ ГЕНОВ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ И ПРОТЕИНКИНАЗ У Quercus robur L. ПРИ ЗАРАЖЕНИИ МУЧНИСТОЙ РОСОЙ (2026)

Читать онлайн

Дуб черешчатый (Quercus robur L.) подвергается заражению одним из самых распространенных фитопатогенов – аскомицетов порядка Erysiphales, возбудителя мучнистой росы, приводящему к снижению продуктивности лесных насаждений данной древесной породы. Однако молекулярно-генетические механизмы устойчивости дуба черешчатого к мучнистой росе все еще недостаточно изучены. В связи с этим целью работы стал поиск генов транскрипционных факторов и протеинкиназ, вовлеченных в формирование адаптации дуба черешчатого к возбудителю мучнистой росы путем анализа данных РНК-секвенирования. Поиск и анализ дифференциальной экспрессии транскрипционных факторов и протеинкиназ осуществлялись с помощью iTAK v2.0.2 и edgeR соответственно. В результате анализа данных РНК-секвенирования было выявлено 2813 значимых дифференциально экспрессируемых генов, в числе которых обнаружено 166 генов транскрипционных факторов и 186 генов протеинкиназ. В условиях заражения мучнистой росой наибольшее количество дифференциально экспрессируемых генов транскрипционных факторов принадлежало семействам MYB (38), AP2/ERF (23), NAC (17) и WRKY (15). Установленго, что при заражении мучнистой росой, наибольшим уровнем экспрессии по сравнению с контролем обладали гены следующих семейств: WRKY, GARPG2- like, BES1 и BBR-BPC. При этом гены семейств транскрипционных факторов C2C2, bZIP, HB-HD-Zip, C2H2, SBP, B3, zf-HD, SRS, OFP и HB-WOX подавлялись в условиях заражения мучнистой росой. Анализ дифференциально экспрессируемых генов протеинкиназ при заражении мучнистой росой у дуба черешчатого выявил, что большая часть генов принадлежит семейству RLK/Pelle (167) обладающих разнонаправленной регуляцией. Другие гены семейств протеинкиназ AGC, NEK, Group-Pl-2, ULK, WNK имели пониженную экспрессию, CAMK – повышенную, STE и TKL – разнонаправленную при заражении мучнистой росой. Выявленные гены могут рассматриваться как перспективные кандидаты для дальнейших функциональных исследований, что позволит определить их вклад в формирование устойчивости дуба черешчатого к мучнистой росе.

Ключевые фразы: quercus robur l, рнк-секвенирование, дифференциальная экспрессия генов, транскрип- ционный фактор, протеинкиназа, мучнистая роса
Автор (ы): ВИШНЯКОВ С.А. (VISHNYAKOV S.A.), Третьякова Анна Вадимовна (Tretyakova A. V.), Зыбинская Полина Алексеевна (Zybinskaya P. A.), Крылов Павел Андреевич (Krylov P. A.)
Журнал: СИБИРСКИЙ ЛЕСНОЙ ЖУРНАЛ

Предпросмотр статьи

Идентификаторы и классификаторы

SCI
Биология
УДК
631.52. Улучшение растений. Прикладная генетика. Селекция и т. д.
Для цитирования:
ВИШНЯКОВ С.А., ТРЕТЬЯКОВА А. В., ЗЫБИНСКАЯ П. А., КРЫЛОВ П. А. ПОИСК ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО ЭКСПРЕССИРУЕМЫХ ГЕНОВ ТРАНСКРИПЦИОННЫХ ФАКТОРОВ И ПРОТЕИНКИНАЗ У QUERCUS ROBUR L. ПРИ ЗАРАЖЕНИИ МУЧНИСТОЙ РОСОЙ // СИБИРСКИЙ ЛЕСНОЙ ЖУРНАЛ. 2026. № 3
Текстовый фрагмент статьи
Моя история просмотров (10)
Будьте первым, кто начнет обсуждение

Если у вас возникли вопросы или появились предложения по содержанию статьи, пожалуйста, направляйте их в рамках данной темы.