Начало цветения у растений регулируется сложными генными сетями, которые интегрируют множественные экологические и эндогенные сигналы, чтобы гарантировать, что цветение произойдет в подходящее время. Это достигается путем точного контроля экспрессии ключевых генов цветения как на транскрипционном, так и на посттранскрипционном уровне. В последние годы показано, что класс малых некодирующих РНК, называемых микроРНК (miRNAs), регулирует экспрессию генов в ряде процессов развития растений. У A. thaliana переход к цветению контролируется несколькими генетическими путями. Это автономный путь, опосредованный этапами развития, фотопериодический, яровизационный и путь с участием гиббереллиновой кислоты. В результате формируется регуляторная сеть, которая согласует эндогенное состояние развития растения с сигналами окружающей среды. В данном обзоре представлены известные сведения, касающиеся механизмов регуляции экспрессии генов цветения с помощью растительных miRNAs, участвующих в различных генетических путях, их способ действия и множественные регуляторные функции. Подробно обсуждаются роли семейств miR156, miR172, miR159/319, miR390 и miR394 в регуляторной сети времени цветения у A. thaliana.
Идентификаторы и классификаторы
- SCI
- Биология
Исследование механизмов адаптации живых организмов к условиям окружающей среды имеет важное фундаментальное значение. Растения ведут прикрепленный образ жизни и не могут использовать стратегию «избегания» при действии неблагоприятных факторов среды. В связи с этим они выработали широкий круг приспособлений для обеспечения выживания, эффективной репродукции и конкурентоспособности в фитоценозе. Решающее значение в адаптации растений играют время начала цветения и сроки прорастания семян (или покой семян). Цветение должно происходить строго в определенное время, чтобы обеспечить максимальный репродуктивный успех. Это достигается путем точного контроля экспрессии ключевых генов цветения как на транскрипционном, так и на посттранскрипционном уровне. У A. thaliana переход к цветению контролируется несколькими генетическими путями. Это автономный путь, фотопериодический, яровизационный и путь с участием гиббереллиновой кислоты. В последнее время исследователи выделяют и генетический контроль цветения, опосредованный этапами развития растений [Li et al., 2023; Zhou et al., 2023]. В результате формируется регуляторная сеть, которая согласует эндогенное состояние развития растения с сигналами окружающей среды.
Если у вас возникли вопросы или появились предложения по содержанию статьи, пожалуйста, направляйте их в рамках данной темы.
Список литературы
1. Крылова Е. А. Роль ортологов гена TFL1 в определении архитектоники растений // Генетика. 2020. Т. 56, № 11. С. 1262-1278. DOI: 10.31857/S0016675820110053
2. Медведев С. С., Шарова Е. И. Генетическая и эпигенетическая регуляция развития растительных организмов (обзор) // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. 2010. Т. 3, № 2. С. 109-129.
3. Abou-Elwafa S. F., Büttner B., Chia T., Schulze-Buxloh G., Hohmann U., Mutasa-Göttgens E., Jung C., Müller A. E. Conservation and divergence of autonomous pathway genes in the flowering regulatory network of Beta vulgaris // J. Exp. Bot. 2011. Vol. 62, no. 10. P. 3359-3374. DOI: 10.1093/jxb/erq321
4. Achard P., Herr A., Baulcombe D. C., Harberd N. P. Modulation of floral development by a gibberellin-regulated microRNA // Development. 2004. Vol. 131. P. 3357-3365. DOI: 10.1242/dev.01206
5. Allen R. S., Li J., Alonso-Peral M. M., White R. G., Gubler F., Millar A. A. MicroR159 regulation of most conserved targets in Arabidopsis has negligible phenotypic effects // Silence. 2010. Vol. 1, no. 1. P. 18. DOI: 10.1186/1758-907X-1-18
6. Allen R. S., Li J., Stahle M. I., Dubroué A., Gubler F., Millar A. A. Genetic analysis reveals functional redundancy and the major target genes of the Arabidopsis miR159 family // PNAS. 2007. Vol. 104, no. 41. P. 16371-16376. DOI: 10.1073/pnas.0707653104
7. Baudry A., Ito S., Song Y. H., Strait A. A., Kiba T., Lu S., Henriques R., Pruneda-Paz J. L., Chua N. H., Tobin E. M., Kay S. A., Imaizumi T. F-box proteins FKF1 and LKP2 act in concert with ZEITLUPE to control Ara-bidopsis clock progression // Plant Cell. 2010. Vol. 22, no. 3. P. 606-622. DOI: 10.1105/tpc.109.072843
8. Bernardi Y., Ponso M. A., Belén F., Vegetti A. C., Dotto M. C. MicroRNA miR394 regulates flowering time in Arabidopsis thaliana // Plant Cell Rep. 2022. Vol. 41, no. 6. P. 1375-1388. DOI: 10.1007/s00299-022-02863-0
9. Chand S. K., Nanda S., Joshi R. K. Regulation of miR394 in response to Fusarium oxysporum f. sp. cepae (FOC) infection in garlic (Allium sativum L) // Front. Plant Sci. 2016. Vol. 7. P.1-12. DOI: 10.3389/fpls.2016.00258
10. Chen X. A MicroRNA as a translational repressor of APETALA2 in Arabidopsis flower development // Science. 2004. Vol. 303. P. 2022-2202. DOI: 10.1126/science.1088060
11. Cheng Y. J., Shang G. D., Xu Z. G., Yu S., Wu L. Y., Zhai D., Tian S. L., Gao J., Wang L., Wang J. W. Cell division in the shoot apical meristem is a trigger for miR156 decline and vegetative phase transition in Ara-bidopsis // PNAS. 2021. Vol. 118, no. 46. e2115667118. DOI: 10.1073/pnas.2115667118 EDN: DAAILP ▼ Контекст
12. Cheng J. Z., Zhou Y. P., Lv T. X., Xie C. P., Tian C. E. Research progress on the autonomous flowering time pathway in Arabidopsis // Physiol. Mol. Biol. Plants. 2017. Vol. 23, no. 3. P. 477-485. DOI: 10.1007/s12298-017-0458-3 ▼ Контекст
13. Davière J. M., Wild M., Regnault T., Baumberger N., Eisler H., Genschik P., Achard P. Class I TCP-DELLA interactions in inflorescence shoot apex determine plant height // Curr. Biol. 2014. Vol. 24, no. 16. P. 1923-1928. DOI: 10.1016/j.cub.2014.07.012
14. Dong Q., Hu B., Zhang C. microRNAs and their roles in plant development // Front. Plant Sci. 2022. Vol. 13. Art. 824240. DOI: 10.3389/fpls.2022.824240 EDN: GJNEHK ▼ Контекст
15. Fahlgren N., Montgomery T. A., Howell M. D., Allen E., Dvorak S. K., Alexander A. L. Carrington J. C. Regulation of AUXIN RESPONSE FACTOR3 by TAS3 ta-siRNA affects developmental timing and patterning in Arabidopsis // Curr. Biol. 2006. Vol. 16, no. 9. P. 939- 944. DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.065 ▼ Контекст
16. Gao J., Zhang K., Cheng Y. J., Yu S., Shang G. D., Wang F. X., Wu L.Y., Xu Z. G., Mai Y. X., Zhao X. Y., Zhai D., Lian H., Wang J. W. A robust mechanism for resetting juvenility during each generation in Arabidopsis // Nat. Plants. 2022. Vol. 8, no. 3. P. 57-268. DOI: 10.1038/s41477-022-01110-4 EDN: FDTVXG ▼ Контекст
17. Galväo V. C., Collani S., Horrer D., Schmid M. Gibberellic acid signaling is required for ambient temperature-mediated induction of flowering in Arabidopsis thaliana // Plant J. 2015. Vol. 84, no. 5. P. 949-962. DOI: 10.1111/tpj.13051
18. Garcia D. A miRacle in plant development: Role of microRNAs in cell differentiation and patterning // Semin. Cell Dev. Biol. 2008. Vol. 19. P. 586-595. DOI: 10.1016/j.semcdb.2008.07.013 ▼ Контекст
19. Giakountis A., Cremer F., Sim S., Reymond M., Schmitt J., Coupland G. Distinct patterns of genetic variation alter flowering responses of Arabidopsis accessions to different daylengths // Plant Physiol. 2010. Vol. 152, no. 1. P. 177-191. DOI: 10.1104/pp.109.140772 ▼ Контекст
20. Hauvermale A. L., Ariizumi T., Steber C. M. Gibberellin signaling: a theme and variations on DELLA repression // Plant Physiol. 2012. Vol. 160, no. 1. P. 83-92. DOI: 10.1104/pp.112.200956 EDN: RJKYGX ▼ Контекст
21. Hobert O. Gene regulation by transcription factors and MicroRNAs // Science. 2008. Vol. 319. P. 1785-1786. DOI: 10.1126/science.1151651
22. Huijser P., Schmid M. The control of developmental phase transitions in plants // Development. 2011. Vol. 138, no. 19. P. 4117-4129. DOI: 10.1242/dev.063511
23. Jones-Rhoades M. W., Bartel D. P.Computational identification of plant microRNAs and their targets, including a stress-induced miRNA // Mol. Cell. 2004. Vol. 14, no. 6. P. 787-799. DOI: 10.1016/j.molcel.2004.05.027
24. Joshi T., Yan Z., Libault M., Jeong D.-H., Park S., Green P. J., Sherrier D. J., Farmer A., May G., Meyers B. C., Xu D., Stacey G. Prediction of novel miRNAs and associated target genes in Glycine max // BMC Bioinf. 2010. Vol. 11. Suppl. 1. S14. DOI: 10.1186/1471-2105-11-S1-S14
25. Jung J. H., Ju Y., Seo P. J., Lee J. H., Park C. M. The SOC1-SPL module integrates photoperiod and gibberellic acid signals to control flowering time in Ara-bidopsis // Plant J. 2012. Vol. 69, no. 4. P. 577-588. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2011.04813.x ▼ Контекст
26. Jung J. H., Seo Y. H., Seo P. J., Reyes J. L., Yun J., Chua N. H., Park C. M. The GIGANTEA-regulated microRNA172 mediates photoperiodic flowering independent of CONSTANS in Arabidopsis // Plant Cell. 2007. Vol. 19, no. 9. P. 2736-2748. DOI: 10.1105/tpc.107.054528 ▼ Контекст
27. Knauer S., Holt A. L., Rubio-Somoza I., Tucker E. J., Hinze A., Pisch M., Javelle M., Timmermans M. C., Tucker M. R., Laux T. A protodermal miR394 signal defines a region of stem cell competence in the Arabidop-sis shoot meristem // Dev. Cell. 2013. Vol. 24, no. 2. P. 125-132. DOI: 10.1016/j.devcel.2012.12.009 ▼ Контекст
28. Lee H., Yoo S. J., Lee J. H., Kim W., Yoo S. K., Fitzgerald H., Carrington J. C., Ahn J. H. Genetic framework for flowering-time regulation by ambient temperature-responsive miRNAs in Arabidopsis // Nucleic Acids Res. 2010. Vol. 38. P. 3081-3093. DOI: 10.1093/nar/gkp1240 EDN: NZJPFH ▼ Контекст
29. Li X., Bian H., Song D., Ma S., Han N., Wang J., Zhu M. Flowering time control in ornamental gloxinia (Sinningia speciosa) by manipulation of miR159 expression // Ann. Bot. 2013. Vol. 111. P. 791-799. DOI: 10.1093/aob/mct034
30. Li Y., Chen T., Khan W. U., An X. Regulatory roles of miRNAs associated with the aging pathway in tree vegetative phase changes // For Res. (Fayettev). 2023. Vol. 3. P. 9. DOI: 10.48130/FR-2023-0009
31. Litholdo C. G., Parker B. L., Eamens A. L., Larsen M. R., Cordwell S. J., Waterhouse P. M. Proteomic identification of putative microRNA394 target genes in Arabidopsis thaliana identifies major Latex Protein family members critical for normal development // Mol. Cell. Proteomics. 2016. Vol. 15, no. 6. P. 2033-2047. DOI: 10.1074/mcp.M115.053124 ▼ Контекст
32. Manassero N. G., Viola I. L., Welchen E., Gonzalez D. H. TCP transcription factors: architectures of plant form // Biomol. Concepts. 2013. Vol. 4, no. 2. P. 111- 127. DOI: 10.1515/bmc-2012-0051 EDN: RHTZUB ▼ Контекст
33. Marquardt S., Boss P. K., Hadfield J., Dean C. Additional targets of the Arabidopsis autonomous pathway members, FCA and FY // J. Exp. Bot. 2006. Vol. 57, no. 13. P. 3379-3386. DOI: 10.1093/jxb/erl073 EDN: IRKRYN ▼ Контекст
34. de Montaigu A., Tôth R., Coupland G. Plant development goes like clockwork // Trends Genet. 2010. Vol. 26, no. 7. P. 296-306. DOI: 10.1016/j.tig.2010.04.003
35. Nakajima M., Shimada A. Takashi Y., Kim Y. C., Park S. H., Ueguchi-Tanaka M., Suzuki H., Katoh E., Iuchi S., Kobayashi M., Maeda T., Matsuoka M., Yamaguchi I. Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors // Plant J. 2006. Vol. 46, no. 5. P. 880-889. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2006.02748.x EDN: MIMAYN ▼ Контекст
36. Palatnik J. F., Wollmann H., Schommer C., Schwab R., Boisbouvier J., Rodriguez R., Warthmann N., Allen E., Dezulian T., Huson D., Carrington J. C., Weigel D. Sequence and expression differences underlie functional specialization of Arabidopsis microRNAs miR159 and miR319 // Dev. Cell. 2007. Vol. 13, no. 1. P. 115-125. DOI: 10.1016/j.devcel.2007.04.012 ▼ Контекст
37. Poethig R. S., Fouracre J. Temporal regulation of vegetative phase change in plants // Dev. Cell. 2024. Vol. 59, no. 1. P. 4-19. DOI: 10.1016/j.devcel.2023.11.010 EDN: JFFBCB ▼ Контекст
38. Rajagopalan R., Vaucheret H., Trejo J., Bartel D. P. A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana // Genes. Dev. 2006. Vol. 20, no. 24. P. 3407-3425. DOI: 10.1101/gad.1476406
39. Rubio-Somoza I., Weigel D. MicroRNA networks and developmental plasticity in plants // Trends Plant Sci. 2011. Vol. 16. P. 258-264. DOI: 10.1016/j.tplants.2011.03.001
40. Rubio-Somoza I., Weigel D. Coordination of flower maturation by a regulatory circuit of three microRNAs // PLoS Genet. 2013. Vol. 9, no. 3. e1003374. DOI: 10.1371/journal.pgen.1003374
41. Samad A. F. A., Sajad M., Nazaruddin N., Fauzi I. A., Murad A. M. A., Zainal Z., Ismail I. MicroRNA and transcription factor: key players in plant regulatory network // Front. Plant Sci. 2017. Vol. 8. P. 565. DOI: 10.3389/fpls.2017.00565
42. Sang Q., Vayssières A., Ô’Maoiléidigh D. S., Yang X., Vincent C., Bertran Garcia de Olalla E., Cerise M., Franzen R., Coupland G. MicroRNA172 controls inflorescence meristem size through regulation of APETALA2 in Arabidopsis // New Phytol. 2022. Vol. 235, no. 1. P. 356-371. DOI: 10.1111/nph.18111
43. Sawa M., Nusinow D. A., Kay S. A., Imaizumi T. FKF1 and GIGANTEA complex formation is required for daylength measurement in Arabidopsis // Science. 2007. Vol. 318. P. 261-265. DOI: 10.1126/science.1146994
44. Schommer C., Bresso E. G., Spinelli S. V., Palatnik J. F. Role of microRNA miR319 in plant development // Signaling and Communication in Plants. 2012. P. 29-47.
45. Schwab R., Palatnik J. F., Riester M., Schommer C., Schmid M., Weigel D. Specific effects of microRNAs on the plant transcriptome // Dev. Cell. 2005. Vol. 8. P. 517-527. DOI: 10.1016/j.devcel.2005.01.018
46. Simpson G. G. The autonomous pathway: epigenetic and post-transcriptional gene regulation in the control of Arabidopsis flowering time // Curr. Opin. Plant Biol. 2004. Vol. 7, no. 5. P. 570-574. DOI: 10.1016/j.pbi.2004.07.002
47. Siriwardana N. S., Lamb R. S. The poetry of reproduction: the role of LEAFY in Arabidopsis thaliana flower formation // Int. J. Dev. Biol. 2012. Vol. 56, no. 4. P. 207-421. DOI: 10.1387/ijdb.113450ns
48. Song J. B., Gao S., Sun D., Li H., Shu X. X., Yang Z. M. miR394 and LCR are involved in Arabidopsis salt and drought stress responses in an abscisic acid-dependent manner // BMC Plant Biol. 2013. Vol. 13. Art. 210. DOI: 10.1186/1471-2229-13-210
49. Song J. B., Gao S., Wang Y., Li B. W., Zhang Y. L., Yang Z. M. MiR394 and its target gene LCR are involved in cold stress response in Arabidopsis // Plant Gene. 2016. Vol. 5. P. 56-64. DOI: 10.1016/j.plgene.2015.12.001
50. Song J. B., Huang S. Q., Dalmay T., Yang Z. M. Regulation of leaf morphology by microRNA394 and its target LEAF CURLING RESPONSIVENESS // Plant Cell Physiol. 2012a. Vol. 53, no. 7. P. 1283-1294. DOI: 10.1093/pcp/pcs080
51. Song Y. H., Smith R. W., To B. J., Millar A. J., Imaizumi T. FKF1 conveys timing information for CONSTANS stabilization in photoperiodic flowering // Science. 2012b. Vol. 336. P. 1045-1049. DOI: 10.1126/science.1219644
52. Srikanth A., Schmid M. Regulation of flowering time: all roads lead to Rome // Cell. Mol. Life Sci. 2011. Vol. 68, no. 12. P. 2013-2037. DOI: 10.1007/s00018-011-0673-y
53. Sun G. MicroRNAs and their diverse functions in plants // Plant Mol. Biol. 2012. Vol. 80. P. 17-36. DOI: 10.1007/s11103-011-9817-6
54. Tian X., Song L., Wang Y., Jin W., Tong F., Wu F. miR394 acts as a negative regulator of Arabidopsis resistance to B. cinerea infection by targeting LCR // Front. Plant Sci. 2018. Vol. 9. P. 1-11. DOI: 10.3389/fpls.2018.00903
55. Tsuji H., Aya K., Ueguchi-Tanaka M., Shimada Y., Nakazono M., Watanabe R., Nishizawa N. K., Gomi K., Shimada A., Kitano H., Ashikari M., Matsuoka M. GAMYB controls different sets of genes and is differentially regulated by microRNA in aleurone cells and anthers // Plant J. 2006. Vol. 47. P. 427-444. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2006.02795.x
56. Turck F., Fornara F., Coupland G. Regulation and identity of florigen: FLOWERING LOCUS T moves center stage // Annu. Rev. Plant Biol. 2008. Vol. 59, no. 6. P. 573-594. DOI: 10.1146/annurev.arplant.59.032607.092755
57. Ueguchi-Tanaka M., Ashikari M., Nakajima M., Itoh H., Katoh E., Kobayashi M., Chow T. Y., Hsing Y. I., Kitano H., Yamaguchi I., Matsuoka M. GIBBERELLIN INSENSITIVE DWARF1 encodes a soluble receptor for gibberellin // Nature. 2005. Vol. 437, no. 7059. P. 693-698. DOI: 10.1038/nature04028
58. Voinnet O. Origin, biogenesis, and activity of plant micrornas // Cell. 2009. Vol. 136, no. 4. P. 669-687. DOI: 10.1016/j.cell.2009.01.046
59. Wang Y., Sun F., Cao H., Peng H., Ni Z., Sun Q., Yao Y. TamiR159 directed wheat TaGAMYB cleavage and its involvement in anther development and heat response // PLoS ONE. 2012. Vol. 7. e48445. DOI: 10.1371/journal.pone.0048445
60. Wu Z., Fang X., Zhu D., Dean C. Autonomous pathway: FLOWERING LOCUS C repression through an antisense-mediated chromatin-silencing mechanism // Plant Physiol. 2020. Vol. 182, no. 1. P. 27-37. DOI: 10.1104/pp.19.01009
61. Wu G., Park M. Y., Conway S. R., Wang J. W., Weigel D., Poethig R. S. The sequential action of miR156 and miR172 regulates developmental timing in Arabidopsis // Cell. 2009. Vol. 138, no. 4. P. 750-759. DOI: 10.1016/j.cell.2009.06.031
62. Yamaguchi N. LEAFY, a pioneer transcription factor in plants: a mini-review // Front. Plant Sci. 2021. Vol. 12. Art. 701406. DOI: 10.3389/fpls.2021.701406
63. Yamaguchi A., Abe M. Regulation of reproductive development by non-coding RNA in Arabidopsis: to flower or not to flower // J. Plant Res. 2012. Vol. 125, no. 6. P. 693-704. DOI: 10.1007/s10265-012-0513-7
64. Yant L., Mathieu J., Dinh T. T., Ott F., Lanz C., Wollmann H., Chen X., Schmid M. Orchestration of the floral transition and floral development in Arabidopsis by the bifunctional transcription factor APETALA2 // Plant Cell. 2010. Vol. 22. P. 2156-2170. 10.1105/ tpc.110.075606. DOI: 10.1105/tpc.110.075606
65. Yao Q., Chen Y., Zhou X. The roles of microRNAs in epigenetic regulation // Curr. Opin. Chem. Biol. 2019. Vol. 51. P. 11-17. DOI: 10.1016/j.cbpa.2019.01.024
66. Yu S., Wang J. W. The crosstalk between microRNAs and gibberellin signaling in plants // Plant Cell Physiol. 2020. Vol. 61, no. 11. P. 1880-1890. DOI: 10.1093/pcp/pcaa079 EDN: TADNOE
67. Zhang Y. Y., Hong Y. H., Liu Y. R., Cui J., Luan Y. S. Function identification of miR394 in tomato resistance to Phytophthora infestans // Plant Cell Rep. 2021. Vol. 40, no. 10. P. 1831-1844. DOI: 10.1007/s00299-021-02746-w
68. Zhu H., Hu F., Wang R., Zhou X., Sze S. H., Liou L. W., Barefoot A., Dickman M., Zhang X. Arabidopsis Argonaute10 specifically sequesters miR166/165 to regulate shoot apical meristem development // Cell. 2011. Vol. 145, no. 2. P. 242-256. DOI: 10.1016/j.cell.2011.03.024
69. Zhou B., Luo Q., Shen Y., Wei L., Song X., Liao H., Ni L., Shen T., Du X., Han J., Jiang M., Feng S., Wu G. Coordinated regulation of vegetative phase change by brassinosteroids and the age pathway in Arabidopsis // Nat.Commun. 2023. Vol. 14, no. 1. Art. 2608.
Выпуск
Другие статьи выпуска
В этом году исполняется 95 лет со дня рождения доктора ветеринарных наук, профессора Вячеслава Алексеевича Берестова, человека, с чьим именем связано создание в 1972 году в Институте биологии Карельского филиала Академии наук СССР лаборатории физиологии пушных зверей (в настоящее время – лаборатория экологической физиологии животных), положившее начало изучению пушных зверей в Карелии. Вячеслав Алексеевич был организатором и первым руководителем лаборатории.
В работе представлен краткий обзор современных сведений о применении бактериоцинов в аквакультурной отрасли. В последние годы с развитием аквакультурного сектора становится актуальной проблема антибиотикорезистентности гидробионтов. Задача замены антибиотиков на более безопасные и действенные вещества стоит перед многими странами. В качестве решения данной проблемы используются бактериоцины – природоподобные антимикробные пептиды. Изучение строения пептидов происходит при помощи метагеномного секвенирования, которое позволяет определить точную аминокислотную последовательность. Проведенный литературный поиск выявил примеры использования в России микробного ила из системы биофлок для объектов аквакультуры в качестве не только очистки воды, но и борьбы с различными заболеваниями. В основном использование бактериоцинов распространено в зарубежных странах, таких как Китай, Япония, Канада, Норвегия; применяются штаммы рода Bacillus, Lactobacillus plantarum 42, Lactobacillus plantarum YRL45, Lactobacillus plantarum W3-2, Lactococcus spp., Педиоцин PA-1 (Pediococcus acidilactici), Pediococcus acidilactici DSM 10313. Выявленные пептиды способствуют улучшению роста и выживаемости рыб, а также качества воды за счет разложения органических веществ; эффективно подавляют патогенную микрофлору, снижают риск заболеваний в аквакультуре; активны против Enterococcus faecalis, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Bacillus cereus и Clostridium botulinum. Добавляя бактериоцины в корма для аквакультуры, можно эффективно снизить зависимость от традиционных методов лечения. Таким образом, бактериоцины представляют собой перспективные антимикробные препараты, которые могут улучшить качество аквакультурной продукции, повысить ее безопасность для потребителей, а также расширить лекарственный рынок для объектов аквакультуры.
Цель исследования – выявление в гибридах картофеля генов, ассоциированных с устойчивостью культуры к основным вирусным заболеваниям и фитофторозу для дальнейшего использования этих гибридов в программе селекции и семеноводства картофеля. Применение маркер-ориентированной селекции (МОС) с использованием ДНК-маркеров позволяет облегчить селекцию сельскохозяйственных растений с комплексной устойчивостью к болезням и вредителям. МОС широко используется для ускорения отбора устойчивых сортов с хорошими агрономическими характеристиками. Для молекулярно-генетического скрининга были взяты гибриды картофеля, которые предварительно оценивались в полевых условиях в соответствии с рекомендациями по селекционному процессу для картофеля на устойчивость к фитопатогенам. Гибриды картофеля получены из селекционного питомника Владикавказского научного центра РАН. Для молекулярного скрининга генотипов картофеля использованы следующие молекулярные ДНК-маркеры: YES3-3A, RYSC3, Ry186, М45, М6, 5Rx1, R1-1205, R3b-378, которые позволяют выявить наличие в геноме гибридных сортов гены устойчивости к вирусам (PVY, PVX) и фитофторозу. На основании молекулярного скрининга выделены гибриды, которые в дальнейшем будут использованы для выведения новых вирусоустойчивых сортов картофеля.
Для внедрения цифровых технологий в ихтиологию и аквакультуру необходимо разработать основы подготовки соответствующей информации. В качестве одного из подходов предлагается использование особенностей формы тела рыбы для обеспечения материалом процесса программирования. В работе оценивалась возможность использования морфометрической информации для обоснования цифровой модели конкретного вида рыбы – плотвы Rutilus rutilus L., 1758. Сбор и обработка материала проведены с использованием традиционных методик ихтиологических исследований. Определена сумма отношений таких параметров, как длина от вершины рыла до вертикали, соединяющей основание брюшного и начало спинного плавника, ширина, высота и обхват тела плотвы, к длине ее тела от вершины рыла до конца чешуйного покрова. Эта сумма может быть принята как основа для цифровизации вида – своеобразный «морфологический паспорт» плотвы при учете пяти проводимых измерений и четырех отношений. Для обоснования использования обезличенной формы представления данных, соответствующих всем видам рыб, зафиксировали по отдельному виду, на примере плотвы, некую искомую «единицу» – длину тела от вершины рыла до конца чешуйного покрова. Получено уникальное сочетание четырех значений отношений по пяти измерениям, которое может быть принято в качестве основы для идентификации плотвы как отдельного биологического вида.
В рамках разработки отечественной диагностической тест-системы с использованием технологии xMAP-ASPE-xTAG с целью ранней диагностики и выявления предрасположенности к развитию меланомы по разработанному авторами протоколу детекции мутаций анализируемых генов в образцах узловой меланомы (NM) и диспластического невуса с пигментным компонентом (DMN) отработаны этапы определения в одном аналите нескольких мутаций, сопряженных с онкогенезом меланомы – BRAF (rs113488022; p. V600E; c.1799T>A), MITF-М (rs149617956; p. E318K; c.952G>A), CDKN2А (rs121913386, p. P114L, c.341C>T; rs121913387, p. R58*, c.172C>T; rs121913388, p. R80*, c.238C>T; rs121913389, p. W110*, c.330G>A; rs1057519852, p. W110*, c.329G>A). У трех пациентов из четырех с локализацией DMN в области тела non-CSD выявлено наличие мутантного варианта гена BRAF. У одного пациента из этой группы определены мутации в трех генах – BRAF, MITF-М, CDKN2А. У одной пациентки не выявлено наличия мутантных вариантов анализируемых генов, в сочетании с гистологическими характеристиками данное образование можно отнести к банальному меланоморфному невусу (доброкачественная меланоцитома). По результатам генетического скрининга выявлены два вида меланом относительно драйверной мутации гена BRAF: 1-я группа – меланомы BRAF-негативные (wtBRAF); 2-я группа – меланомы BRAF-позитивные (mtBRAF). У всех трех пациентов с узловой меланомой с пигментным компонентом (NM) wtBRAF образования локализованы в соответствии с кумулятивным солнечным повреждением lowCSD, выявлена мутация гена CDKN2A и дополнительно у двух пациентов – мутация гена MITF-М. В группе mtBRAF меланом (пять пациентов) выявлены меланомы как mtBRAF NM с пигментным компонентом, так и mtBRAF амеланотического варианта NM (ANМ). В частности, mtBRAF NM обнаружена у трех пациентов, и у одного из этой группы дополнительно выявлена мутация MITF-М. Также к данной группе отнесли двух пациентов mtBRAF ANM, при этом у пациента женского пола дополнительно выявлена мутация CDKN2A. Все образования данной группы с локализацией в соответствии с кумулятивным солнечным повреждением как lowCSD, так и highCSD. Оптимизация условий проведения исследований позволила достичь приемлемой чувствительности и надежной производительности детекции анализируемых мутаций генов.
Целью работы является оценка влияния применения комплекса растительных добавок с включением антимикробного пептида Педиоцин PA-1 в качестве кормовой добавки для рыб. Объектом исследования определен гибридный вид осетровых ЛенКа, полученный в результате скрещивания ленского осетра и калуги (Acipenserbaerii × Husodauricus) для улучшения их характеристик, таких как рост, сопротивляемость заболеваниям и качество икры. Используемые методы: изготовление опытного образца корма с новой кормовой добавкой, лабораторные исследования питательности и аминокислотного состава экспериментальной партии на соответствие комбикормам для гибридов осетровых рыб. Разработанный корм с добавлением антимикробного пептида Педиоцин РА-1 оказывает положительное влияние на общее состояние рыб, обеспечивает прирост массы. Предлагаемый корм характеризуется высокой поедаемостью гидробионтами, что подтверждает отсутствие визуально определяемых остатков корма в водной среде. Это позволяет минимизировать риск загрязнения воды продуктами распада корма и, как следствие, способствует поддержанию стабильных гидрохимических показателей. Во многих государствах аквакультура играет ключевую роль в обеспечении местного населения качественной рыбной продукцией. За последние десятилетия объемы производства в этой отрасли увеличились колоссально, примерно в 12 раз. Важнейшим фактором для получения высококачественной и рентабельной рыбной продукции является использование сбалансированных кормов, содержащих все необходимые питательные и биологически активные элементы. Применение новой кормовой добавки позволит расширить рынок кормов для аквакультуры и снизить затраты на очистку воды за счет минимизации отходов.
Приводятся результаты оценки эффективности использования молекулярного маркера BpCW1 для раннего обнаружения признака «узорчатая древесина» у вегетативного потомства карельской березы Betula pendula Roth var. carelica (Mercklin) Hämet-Ahti на этапе его клонального микроразмножения в культуре in vitro. У исходных (материнских) деревьев этот признак проявляется, как правило, к возрасту 8–10 лет в виде выпуклостей или утолщений на поверхности ствола. В качестве контрольных служили клоны (in vitro) березы повислой (Betula pendula Roth), березы пушистой (Betula pubescens Ehrh.) и их разновидностей (которые имеют преимущественно декоративную форму или окраску листовой пластинки). В результате ПЦР-анализа у 87,5 % клонов карельской березы идентифицированы продукты амплификации (476 п. н. или 530/476 п. н.), соответствующие делеции (утрате) участка ДНК размером 54 п. н., связанной с признаком «узорчатая древесина». Установлено, что у 62 % клонов делеционный аллель представлен в гомозиготном состоянии, а у 38 % – в гетерозиготном. Сравнительный анализ вегетативного потомства в зависимости от его географического происхождения показал, что у карельской березы, имеющей карельское происхождение, аллели значительно чаще (более чем в 1,4 раза) находятся в гетерозиготном состоянии, чем в гомозиготном. У клонов, исходные деревья которых произрастают (или произрастали) в других российских регионах (например, в Смоленской области) или в Беларуси, Дании и Финляндии, соотношение аллелей было иным. Использование маркера BpCW1 подтвердило также отсутствие аллеля с делецией 54 п. н. у других представителей рода Betula (входящих в состав ранее созданной коллекции клонов in vitro), что соответствует свойственной для них прямослойной текстуре древесины. Полученные данные свидетельствуют о возможности использования молекулярного маркера BpCW1 для выявления делеции, локализованной на 10-й хромосоме в геноме карельской березы, сцепленной с признаком «узорчатая древесина», у клонов, культивируемых в условиях in vitro, исходные деревья которых отобраны исключительно на основании внешних косвенных признаков. Это позволит ускорить решение ряда вопросов, связанных с селекцией карельской березы, а также с отбором исходных генотипов при создании промышленных плантаций с целью выращивания деревьев с заданными свойствами в коммерческих целях.
Аденозиновый путь играет важную роль в развитии патологий печени, в частности за счет ограничения воспалительных реакций. Значение экто-5’-нуклеотидазы (CD73), гидролизующей АМФ до внеклеточного аденозина, при развитии метаболически ассоциированной жировой болезни печени (МАЖБП) изучено недостаточно. В работе представлены результаты исследования уровня мРНК гена NT5E, кодирующего CD73, и содержания CD4+ Т-клеток и CD14+ моноцитов, экспрессирующих CD73, в крови больных разными формами МАЖБП – стеатозом печени (СП) и метаболически ассоциированным стеатогепатитом (МАСГ). В группах здоровых людей (n = 29), больных СП (n = 31) и МАСГ (n = 25) в периферической крови определяли уровень мРНК гена NT5E методом ПЦР в режиме реального времени и содержание CD73+ клеток методом проточной цитометрии. Проведена оценка связи исследуемых показателей с клинико-лабораторными показателями крови. Несмотря на то что уровень экспрессии гена NT5E в ЛПК обследованных групп не отличался, нами были обнаружены изменения в содержании отдельных популяций клеток, экспрессирующих CD73. У больных МАЖБП как при СП, так и при МАСГ содержание CD4+CD73+ Т-хелперов оказалось выше, чем у здоровых людей (p = 0,0096 и 0,0008 соответственно). Содержание CD14+CD73+ моноцитов у больных МАЖБП, напротив, было снижено в группе СП (p = 0,0013). Обнаружена положительная корреляция между уровнем мРНК гена NT5E и уровнем С-реактивного белка (r = 0,566, p = 0,047) у больных МАСГ. Таким образом, у больных МАЖБП и здоровых доноров содержание CD73+ иммунных клеток отличается, что может быть связано с патогенезом заболевания и требует дальнейшего исследования.
Проведен анализ 15 образцов плацентом (1×1 см), полученных от трех 4-летних важенок домашних северных оленей непосредственно в родах. Образцы тканей были помещены в 10% раствор нейтрального формалина для фиксации. Далее проводилась их дегидратация путем последовательного погружения в спиртовые растворы возрастающей концентрации. После подготовки образцов их обработали хлороформом на гистологическом процессоре Cytadel 2000 (Shendon) для просветления, а затем залили в парафин Histomix («Биовитрум»), чтобы подготовить к дальнейшему анализу. Парафиновые блоки нарезали на тонкие срезы с помощью микротома MICROM HM340E. Микроскопическое исследование и документирование полученных срезов проводилось на микроскопе AxioScope. A1 (ZEISS), оборудованном цифровой камерой AxioCam MRc5. Анализ микропрепаратов не выявил прямого контакта между ворсинками хориоаллантоиса и эпителиальными клетками матки. Исследование установило достаточно хорошее кровоснабжение плаценты, включая амниотическую оболочку и ворсины хориоаллантоиса (как стволовые, так и терминальные). Коллагеновые волокна составляли основу как утолщенной стромы амниотической оболочки, так и различных типов ворсин хориоаллантоиса. Во всех исследованных образцах плаценты были замечены выросты амниотической оболочки, покрытые многослойным эпителием. Этот эпителий был представлен высокими призматическими клетками, характеризующимися наличием множества длинных микроворсинок на апикальной поверхности, формирующих выраженную щеточную кайму. Цитоплазма этих клеток содержала значительное количество вакуолей и бурых включений, которые оказались ШИК-позитивными. Основным компонентом межклеточного вещества были кислые мукополисахариды. В соединительной ткани ворсинок хориоаллантоиса обнаружено значительное количество макрофагов. Наблюдаемые особенности гистоархитектоники плаценты важенок домашнего северного оленя отражают адаптивные механизмы жвачных млекопитающих, связанные с успешным вынашиванием и рождением потомства в экстремальных условиях климата Арктической территории Республики Саха (Якутия).
Феномен фотоповреждения листьев в виде потенциально летального межжилкового хлороза и некроза, наблюдаемый у некоторых видов растений (томат, баклажан, огурец и др.) в условиях длинных фотопериодов, включая круглосуточное освещение (КО), был впервые описан более 100 лет назад, однако причины его до сих пор не вполне ясны. В последние годы интерес к этому явлению заметно усилился, поскольку выращивание растений в условиях КО при относительно невысокой плотности потока фотонов считается одним из возможных эффективных способов экономии ресурсов и повышения продуктивности растений в теплицах и на фабриках растений с искусственным освещением. В статье обобщены и проанализированы литературные и собственные данные в поддержку или против имеющихся на сегодняшний день гипотез, объясняющих причины фотоповреждения листьев в условиях длинных фотопериодов. Среди них называют фотоокисление, гипераккумуляцию крахмала и растворимых сахаров, индукцию процесса старения, несоответствие между частотой внутренних (циркадных) биоритмов и внешних свето-темновых циклов и др. Авторы констатируют, что, несмотря на почти вековую историю изучения, пока так и не найден однозначный ответ на вопрос, почему КО оказывает положительное воздействие на одни виды и отрицательное на другие и каковы причины фотоповреждения листьев. Ни одна из существующих гипотез пока не нашла надежного экспериментального подтверждения. По-видимому, в условиях КО фотоповреждение листьев у чувствительных видов возникает в силу ряда причин, из которых трудно выделить одну главную, но, возможно, первой в цепочке последовательных событий, заканчивающихся хлорозом и некрозом листьев, является циркадная асинхрония, то есть сбой эндогенной циркадной ритмики многих процессов, возникающий в растениях в результате воздействия аномального свето-темнового цикла.
Издательство
- Издательство
- КарНЦ РАН
- Регион
- Россия, Петрозаводск
- Почтовый адрес
- просп. Александра Невского, 50
- Юр. адрес
- просп. Александра Невского, 50
- ФИО
- Бахмет Ольга Николаевна (Генеральный директор )
- Контактный телефон
- +7 (814) 2766040